公元前537年，鲁昭公大会国人，宣布鲁国裁撤中军，将左右军交给季孙宿、孟孙获与叔孙诺三桓统领，连军赋都要先交给他们。此举大违礼制，触动了年幼的孔丘。孔丘向鲁国左太史请教何为圣人，却因被拉去吹鼓挣干肉而被左太史鄙弃。孔母颜徵在请其表兄冉夫子告知了孔丘他的身世。此时孔丘的异母兄孟皮迫于其母之命来向颜徵在索要叔梁纥的佩剑。这把佩剑是作为父亲的叔梁纥留给孔丘以示士人身份、叔梁纥之子的凭证，但颜徵在可怜孟皮而把佩剑给了他，并阻止孔子追讨，命其专心求学。孔丘遵照母命拜师左太史，左太史开始时并不想收下他，但孔丘足足等了一天，左太史最终答应了，孔丘这年15岁。公元前535年，颜徵在积劳成疾，死于织布机前，享年32岁。

孔丘想将父母合坟同葬却不知道父坟所在，无奈，他只得将柩车停在曲阜的大道口，跪于路旁向国人求问。鲁昭公经过，为孔丘知礼孝顺所感动，派人吊唁。冉夫子终于问来了叔梁纥坟所在，孔丘兴奋之余昏了过去。季氏大宴士人。孔丘也想赴宴，却被季氏家臣阳虎拒之门外。孟皮找到孔子，二人和好。公元前533年，孔丘行加冠礼，季氏请其出仕，孔丘答应。孔丘随左太史来到鲁国太庙，拜谒周公灵位，遇到鲁昭公，昭公准其常来太庙学习礼乐。孟皮考虑到孔子已大，为其娶妻，孔子以兄长未娶为由拒绝了。孟皮以庶人盟誓之礼成婚，将聘礼用的丝帛粮食省下来给孔丘。孔丘大为感动，尊兄命与亓官氏按士人六礼成婚。

孔丘生子，恰逢子家羁奉鲁君之命送来一尾鲤鱼，孔丘遂为子起名“孔鲤”。公元前522年，孔子向师襄子学琴，对《文王操》颇有感悟。是年，齐景公、晏子来访，鲁国以三桓之一的季孙意如为傧相，季孙意如按照孔子的教授，依礼举办了盛大的欢迎仪式，令人耳目一新。齐景公请见孔子，并与之探讨秦穆公称霸等事，为其才学所折服，甚至想带孔子仕齐。虽然鲁国没有放走孔子，但对于是否重用他还是争议重重，并最终还是没能重用他。孔子在他人的建议下，开始办学。

孔子办学，受膑之人漆雕开前来拜师，孔子却因为他身份低贱，不愿收他，漆雕开怒而离开。次日孔子带领弟子习射，草民仲由前来挑衅，却因为孔子射术精湛未敢有过分之举。经过此事后，孔子提出了“有教无类”的主张，恰巧被前来寻事的仲由等人听到，仲由遂不再生事，转而拜孔子为师。孔子的私学办得风生水起，但同时也招致鲁国部分贵族的不满。公元前519年，鲁国大夫郈昭伯就孔子办学一事与诸大夫起了争执，郈昭伯害怕孔子办学会助长三桓势力，因此向鲁昭公建言，阻止孔子办学，以削弱三桓势力，但昭公觉得此举无益，没有答应。公元前518年，孟孙获薨，临死前命二子孟孙何忌、南宫敬叔拜孔子为师。孔子在教授《关雎》一诗时，仲由和孟孙何忌殴打起来，孔子偏袒孟孙何忌的做法令仲由失望不满，孔子得知仲由家境后反思自己，提出“贵贱有别”的思想，并

孔子准备前往洛邑向老子求教，孟孙何忌按照孔子的意愿代表孟叔季三家同鲁昭公汇报，获得了同意，孔子遂在鲁昭公提供的车马用度的支持下带着仲由、南宫敬叔踏上了问道老子之路。孔子在将至洛邑时迷失了路途，却恰巧遇到了倒骑青牛的老子，老子猜出了孔子的身份，也知道了他们此行的目的，虽为其指明了道路但没有点明自己的身份。孔子沐浴之后前去拜访老子，寒暄之后老子令童子带领孔子等人参观成周古迹，孔子遂按照老子的安排在洛邑暂居。与此同时，郈昭伯与季孙意如斗鸡时为鸡带铜爪取胜，阳虎揭发并斗杀郈昭伯之门客，两家矛盾激化。孔子在洛邑待了三个月之后被老子再次约见，老子借助日食讨论周礼、自然之道。二人谁也说服不了谁，但却都颇有收获。临别之时，老子赠言相别，孔子也发出“老子若龙”的由衷赞叹。此时的鲁国，郈昭伯正鼓动鲁昭公收回君权

孔子得知鲁昭公出走齐国决定追随，孟叔季三家同意。孔子赴齐途中听到了《韶》乐，喜悦之余却不解为何乐师不在齐朝演奏。孔子至齐后被齐国四大家族高、栾、鲍、田之一的高张所招揽。为了能留在齐国助鲁君归国，孔子同意了做高张的家臣。孔子出游，在街市上看到假脚生意火爆，认为齐国刑罚过重。正在此时，孔子遇到了“大斗进小斗出”以招揽民心的田氏家主田乞（剧中以其出身国陈国为姓，称其为陈大夫），陈大夫暗示孔子不必做家臣也可入仕，含蓄表达了自己的不满。晏子发觉孔子已经卷入了高、田两家的斗争中，甚至有着生命危险，心内焦虑，在与孔子义利之争无果后，晏子为了保全孔子，决定劝说齐景公拒绝孔子入仕的请求。虽然孔子一番“君君臣臣父父子子”的高论令齐景公想重用他，但齐景公为了避免高、田两家矛盾的激化损害齐国，也为了保护孔子免遭杀害

孔鲤娶妻，孔子女儿孔娆见状也催促自己的爱人、孔子弟子公冶长赶紧提亲，但公冶长由于曾蒙冤入狱导致脸上留有黥印而自觉无颜，准备悄悄离开，却被孔娆、孔子发觉。亓官氏告诉了孔子孔娆与公冶长的爱情，孔子欣然答应了二人的婚事。公元前510年，鲁昭公薨于晋国，孔子悲愤之余提出了“仁”的主张。公元前505年，老迈的季孙意如自感时日无多，执意要在祭祀时佩戴璠玙并使用八佾舞，而这些都是君上才能用的。孔子得知后非常不满，拒绝了季氏邀自己做傧相的请求。季孙意如最终虽得偿所愿，但却令孔子大为光火。季孙意如旋即薨殂，其子季孙斯继位。阳虎趁丧变乱，夺取季孙氏家政并插手国政。孟叔季三家不满阳虎独揽大权，准备求助于孔子，而阳虎也想借助孔子的声望为自己正名。孔子多次拒绝了阳虎的邀请，阳虎遂趁孔子外出命人送礼，而按照孔子“来而不

公元前502年，阳虎意欲杀害季孙斯事败，孟叔季三家联合起来抵御阳虎，历时一年，于公元前501年平定。孟叔季三家决定起用孔子做中都宰。孔子上任后，中都大治，端木赐（子贡）前来拜师。孔子后升任司空，并在离开中都途中收下了弟子高柴。公元前500年，孔子升任为大司寇，成为与三家并列的上卿大夫。齐国得知鲁国大治有所担忧，对此，黎鉏主张离间，田乞（陈大夫）主张讨伐，高张主张结盟。齐景公询问了卧病在家的晏子，最终决定结盟。齐鲁两国举行夹谷会盟，齐国得知鲁国是孔子做相礼，认为其知礼而少谋，决定借会盟压服鲁国，如若不成便以武力威胁。会盟仪式上，鲁国拒绝了齐国强加的屈辱条款，黎鉏献上四方之乐想胁迫鲁定公，被孔子驱逐，黎鉏遂呼甲士，不成想鲁国早有防备，甲士兵车比齐国还多，齐景公最终只好与鲁结盟，归还郓、欢、龟阴三

叔孙武叔家臣候犯叛乱之事令三桓担忧，在看到季孙氏的家臣公山弗狃公然违抗讨伐候犯的命令之后，季孙斯和孔子决定削除三桓家臣的势力，遂于公元前498年开始堕毁三桓的都邑，史称“堕三都”。冉求明白孔子此举名为削弱家臣，实为削弱三桓兴盛公室。叔孙氏的郈邑被堕除后，公山弗狃拒绝堕除自己的根据地、亦即季孙氏的费邑，故而变乱，季孙斯和鲁定公被困，但最终被孔子发动的国人以及孟孙、叔孙两家打败。叛乱平定后，孔子在教学中提出了“恕”、“己所不欲勿施于人”等思想。孟孙何忌听从家臣公敛处父的意见，拒绝堕除郕邑，孔子交涉无果后发兵攻打，不料叔孙、季孙两家暗中已经与孟孙交好，公然反水，堕三都宣告失败。

公元前497年，齐国以修好为名，送给鲁国一些女乐纹马，孔子以之为怀柔腐蚀之物而反对接受，季孙斯却执意收下。夜半，季孙斯与鲁定公微服前往齐使黎鉏榻处，意欲偷赏女乐。齐女跳舞，许多鲁国国人前来观看。一曲舞毕，国人离开，鲁定公与季孙斯现身，齐女又跳起一曲狂放诱惑的舞蹈。孔子知道自己的弟子也去观看后颇为不满。鲁定公自获得女乐之后连续三日不再上朝理政，尽管在孔子的坚持下鲁定公接见了孔子，但其已被莺歌燕舞销蚀了。孔子郁郁寡欢，亓官氏也为孔鲤夫妻没有生子而不快，由于孔子反对纳妾，遂劝孔子休掉孔氏另娶一房，无果。此时冉耕因身染恶疾从中都回来，为害怕传染而拒绝与亲自上门的孔子相见，孔子无奈之下只能执其手而泣。鲁国郊祭大典上，鲁定公中途溜走而没有分发胙肉，这令孔子彻底失望，决定离鲁。孔子走到鲁国边境，依礼下帐三

孔子来到卫国帝丘，住在颜浊邹家。卫国国君卫灵公惧内虚荣，君夫人南子淫荡霸道，和大夫弥子瑕有染。卫灵公为了保全自己重贤爱才的名声，很快便召见了孔子并给予厚禄。由于孔子没有按卫国规矩拜见南子，南子遂不许卫灵公重用孔子，还借着床上云雨的机会，诱使卫灵公派弥子瑕监视孔子，这令孔子及其好友蘧伯玉大为不满。孔子收下颜浊邹等人为徒。一段时间后孔子忍无可忍，决定离开卫国，却因为颜刻指错了路径，南投匡地。匡地为公叔戍之所在，其正欲发动叛乱铲除南子，听闻孔子来到遂邀其共同起事，但被孔子拒绝。公叔戍便将孔子围困在匡地，但由于担心骂名，还是在孔子突围之时顺势放了他们。公叔戍得知孔子按原路返回，担心叛乱泄露，于是追上阻止，孔子假意盟誓骗走公叔戍后，重往帝丘。

孔子回到卫国，卫灵公亲来迎接，并安排孔子住在宾舍。南子坚持只要孔子不来拜见，就不得重用他，孔子也为是否去拜见南子而苦恼。孔子击磬于卫，有荷蒉而经过者，发出“深则厉，浅则揭”的议论。南子听到乐声苦闷，遂决定请孔子来访。孔子应邀，南子说自己可以帮助孔子出仕，以为自己正名，孔子拒绝了她。仲由因孔子见南子而生气，孔子发出“天厌之”的毒誓。南子叫卫灵公只是把孔子闲养起来，以备咨询便可，不予重用。卫灵公出游与南子同车，孔子不愿与南子共乘，只得坐童仆之车，并发出“吾未见好德如好色者”的感叹。公元前493年，卫灵公之子蒯聩叛乱，孔子发现卫灵公对自己所言毫无兴趣，决定离开卫国，临走前说道：“唯女子与小人难养也，近之则不逊，远之则怨。”

孔子将赴晋国，却听闻赵鞅杀了窦鸣犊、舜华，临黄河而返。往晋不成转赴曹，曹国也容不得孔子，孔子只好又去宋国。在宋国城外，孔子见到一副巨大精美的石椁，得知是司马桓魋的之后，骂道：“若是其靡也，死不如速朽之愈也。”桓魋怒而不纳孔子，还将自己力主拜见的弟弟司马牛囚禁了起来。孔子无法进城，便率领众弟子向大树演礼，桓魋命人伐树，为国人阻拦，桓魋遂决定杀掉孔子。司马牛逃出报信，孔子等人四散奔逃，约定郑国城门会合。走散的颜刻、闵损、端木赐、颜回相继回来，子贡说道有老者将孔子喻为“丧家之犬”。公元前492年，季孙斯薨，其子季孙肥继位，并准备按照季孙斯遗命召回孔子，但考虑到孔子主张难以推行，便只召回了冉求。

公元前489年，吴国攻打陈国，楚昭王救陈，听说孔子在陈，遂相请。孔子临水，欲寻渡口，子路询问老人，却被老人讥笑“四体不勤五谷不分”。孔子拜谒两位老者，老者为其占卜，指出其将困顿，并以《易》相赠。孔子在离开蔡国之时被蔡国阻拦，围困在陈蔡之间，一度粮食断绝，孔子一行人陷入极大的困境。高柴带着楚国国君的信函偷偷溜出，带来楚国援兵。众人刚刚脱险，楚昭王暴卒，执政的大夫子西没有接纳孔子，孔子只能回到卫国。

公元前484年，齐鲁交战，鲁国在冉求的领导下大获全胜，冉求、端木赐等弟子趁势求情三桓迎回孔子，三桓答应。鲁国边境上，孔子与来迎接自己的曾点、孔鲤、孔娆等一众弟子亲人相见，却得知了亓官氏已经去世的消息。孔子悲痛之余，让尚未生子的孔鲤再娶一房，以告慰亓官氏至死没能抱上孙子的遗憾。鲁哀公和三桓前来拜见孔子以问治国之道，季孙肥叫鲁哀公封孔子为国老，其实是有名无实。仲由、曾点、冉求、公西赤侍坐，夫子喟然叹曰：“吾与点也。”孔鲤续妻有孕，孔子颇为欣慰。冉求作为季氏家臣，询问孔子对改丘赋为田赋一事的意见，孔子不以为然，二人争辩无果，孔子见到冉求一心为季氏谋利，大怒曰：“非吾徒也！小子鸣鼓而攻之可也。”出仕的高柴回来请仲由到卫国做官，孔子与众弟子团聚并原谅了冉求。送别仲由时，孔子预感此为永别。孔鲤续妻分娩，

公元前482年，孔子经过一年多的准备，开始修订鲁国史书《春秋》，此举引起巨大争议，但最终三桓还是默许了。季孙肥不甘心，想要阻止孔子，但是孔子不为所动。孔子作春秋而乱臣贼子惧。齐国大夫陈恒弑君，孔子先后请求鲁哀公和三桓出兵讨伐，却被一一拒绝。孔子感到修《春秋》对礼崩乐坏的现状毫无帮助，遂停笔。颜回因为过度操劳，先孔子而死，这令孔子大为悲痛。公元前480年，卫国内乱，仲由被剁成肉酱，孔子闻讯昏了过去。孔子梦到先人棺木，自觉时日无多，在留下了“天下大同”的教诲之后，一代圣人、至圣先师孔子，于公元前479年去世，享年73岁。